Тема
Р212-04-003 «Решение комплексных проблем по направлению исследований «Разработка новых методов оценки генетического разнообразия природных популяций с помощью полногеномного секвенирования»
Аннотация
Руководители проекта: декан биолого-почвенного факультета, д.б.н., профессор А.Н. Матвеев, д.б.н., профессор В.П. Саловарова , д.б.н. Д.Ю. Щербаков.
Наименование структурного подразделения ИГУ, в котором реализуется проект: Биолого-почвенный факультет.
Цель проекта:
Создание комплекса методов анализа биологических объектов на основе информации об их геномах.
Ожидаемые научные результаты проекта
1. Выбор формата и создание базы данных ваучерных образцов и препаратов нуклеиновых кислот, предназначенных для использования в ССП и доступной для зарегистрированных пользователей сети интернет. Результат – публикация соответствующего сайта с базой данных.
2. Отбор представителей основных, наиболее разнообразных в видовом отношении групп байкальских животных и растений, выделение нуклеиновых кислот несколькими методами и амплификация фрагментов наиболее подходящих для штрих-кодирования соответствующих групп. Результат этапа – выбор молекулярных маркеров, оценка методов экстракции нуклеиновых кислот, на основании этого планируется издание методической рекомендации.
3. Анализ методов концентрирования и фиксации водных образцов, сравнительная характеристика методов выделения нуклеиновых кислот, выбор системы праймеров разного уровня специфичности для оценки генетического разнообразия микробных популяций с помощью метагеномного подхода, реализованного на основе ССП. Публикация методической разработки.
4. Разработка методов использования препаратов ДНК в вариантах ССП, предназначенных для анализа генетического разнообразия популяционных образцов. Подготовка методических рекомендаций.
5. Разработка концепции, теоретического аппарата и соответствующего программного обеспечения для поиска функционально важных некодирующих участков геномов, обладающих консервативной вторичного структурой. Результат – доклад на международной конференции и публикация.
6. Анализ полученных и опубликованных полногеномных последовательностей модельных организмов. Публикация результатов исследования.
Бюджет проекта
|
|
Всего на 2012 г.
|
Всего на 2013 г.
|
Всего на 2014 г.
|
|
ВСЕГО РАСХОДОВ
|
1 000 000
|
1 000 000
|
1 000 000
|
Планируемые показатели
|
Показатели
|
Плановые значения по годам
|
|||
|
Единица измерения
|
2012 год
|
2013 год
|
2014 год
|
|
|
Количество планируемых к защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата и доктора наук, подготовленных в рамках реализации проекта
|
ед.
|
1 канд
|
1 канд
|
2 канд 1 докт
|
|
Количество публикаций:
в том числе:
|
ед.
|
|
|
|
|
монографии
|
ед.
|
-
|
1
|
1
|
|
учебники и учебные пособия
|
ед.
|
1
|
3
|
5
|
|
статьи в российских научных журналах из списка ВАК
|
ед.
|
1
|
4
|
7
|
|
статьи в рецензируемых зарубежных журналах
|
ед.
|
|
1
|
2
|
|
другие статьи, тезисы докладов конференций
|
ед.
|
5
|
15
|
25
|
|
Количество заявок на получение охранных документов на результаты интеллектуальной деятельности, полученных в рамках реализации проекта
|
ед.
|
-
|
-
|
-
|
|
Защиты диссертаций аспирантами в течение периода обучения
|
ед.
|
-
|
1
|
-
|
|
Защиты диссертаций аспирантами в течение года после окончания аспирантуры
|
ед.
|
-
|
-
|
1
|
|
Количество студентов, участвующих в выполнении НИР с оплатой труда
|
ед.
|
3
|
4
|
5
|